Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rin3P59729 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rin3P59729 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rin3P59729 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms