Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nphp4P59240 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms