Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Samsn1P57725 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Samsn1P57725 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms