Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bace1P56818 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bace1P56818 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms