Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckbrP56481 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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