Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CartptP56388 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CartptP56388 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CartptP56388 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CartptP56388 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CartptP56388 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CartptP56388 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CartptP56388 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CartptP56388 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CartptP56388 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CartptP56388 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CartptP56388 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CartptP56388 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CartptP56388 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms