Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acod1P54987 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Acod1P54987 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms