Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ephb3P54754 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ephb3P54754 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms