Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atxn1P54254 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms