Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr4P51680 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms