Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa8P50706 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms