Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BckdhaP50136 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms