Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cav1P49817 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cav1P49817 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms