Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psen1P49769 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms