Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hcls1P49710 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcls1P49710 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms