Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtpreP49446 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtpreP49446 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms