Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms