Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl5P47962 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl5P47962 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms