Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11bP46638 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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