Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tac1P41539 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tac1P41539 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms