Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc19a1P41438 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc19a1P41438 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms