Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl28P41105 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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