Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chd1P40201 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd1P40201 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Chd1P40201 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chd1P40201 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms