Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh4P39038 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms