Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprkP35822 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprkP35822 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprkP35822 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprkP35822 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprkP35822 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms