Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms