Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nedd1P33215 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms