Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms