Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd2P30280 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms