Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VtnP29788 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
VtnP29788 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VtnP29788 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VtnP29788 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms