Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Col2a1P28481 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Col2a1P28481 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms