Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjb3P28231 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb3P28231 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms