Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjc1P28229 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms