Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd40lgP27548 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms