Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NdnP25233 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NdnP25233 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NdnP25233 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NdnP25233 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NdnP25233 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms