Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1bP25119 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1bP25119 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms