Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NelfeP19426 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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NelfeP19426 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NelfeP19426 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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