Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtpraP18052 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PtpraP18052 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms