Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb1P17919 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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