Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vpreb1P13372 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms