Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nr4a1P12813 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nr4a1P12813 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms