Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApcsP12246 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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