Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spp1P10923 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spp1P10923 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms