Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl2P10148 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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