Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp28P10078 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp28P10078 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms