Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb2P0C1T1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb2P0C1T1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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