Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TtrP07309 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtrP07309 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtrP07309 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TtrP07309 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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TtrP07309 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TtrP07309 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TtrP07309 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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