Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csf1P07141 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csf1P07141 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms