Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt1P04104 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt1P04104 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms