Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-AaP01910 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-AaP01910 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms